Neben den vielen evangelischen und katholischen Hochschulen gibt es in Deutschland auch eine jüdische Hochschule: Die Hochschule für Jüdische Studien (HfJS) in Heidelberg. Sie wurde 1979 gegründet und wird vom Zentralrat der Juden in Deutschland getragen. Sie ist eine staatlich anerkannte, eigenständige Hochschule und arbeitet eng mit der Ruprechts-Karl Universität in Heidelberg zusammen. Die Hochschule für Jüdische Studien wurde als Ausbildungsstätte für Rabbiner, Kantoren und Religionslehrer gegründet. Das Fach „Jüdische Studien“ steht aber Bewerbern jeder Konfession offen. Zum Beispiel kann man einen Bachelor im Fach „Jüdische Studien“ in Kombination mit einem weiteren Fach machen, das an der Ruprecht-Karls-Universität angeboten wird.
Und noch eine Ausnahme gibt es: die staatlich anerkannte Theologische Hochschule Friedensau der Freikirche der Siebenten-Tags-Adventisten in Möckern-Friedensau. Die Kirche der Siebenten-Tags-Adventisten (STA) ist eine protestantische Freikirche aus den USA. Die Hochschule hat in Deutschland eine lange Tradition: Bereits 1899 wurde sie als „Industrie- und Missionsschule“ gegründet. Heute bietet sie die Fachbereiche „Theologie“ und „Christliches Sozialwesen“ an.